清河城是努尔哈赤的眼中钉、肉中刺，使他时刻感到是个威胁。

四年前，明朝巡抚山东都御史翟凤种曾经说过：建州奴隶主们最贪的是清河、抚顺两个市场贸易之利，最害怕的是抚顺、清河两处官军的&ldo;捣剿&rdo;[25]。

因为抚顺、清河两城是后金通向辽沈的门户，离赫图阿拉最近，路途也比较方便。

这自然对后金是个最大的威胁，使努尔哈赤时刻不能安枕。

清河攻守战前，明经略杨镐，曾以清河城四山环抱，只有正东一路通向鸦骨关（今辽宁省新宾县西南三道关），以守为绝境，以战为奇地，用四个月时间，进行了认真的修筑。

城上布列火炮、枪、铅子、铁弹子等武器，并指令守将邹储贤说，敌人若来侵犯，应设伏于城外的山径小路或山间之地以牵制敌兵，万万不可拥兵于城内，束手待毙[26]。

杨镐的这个守城指令是正确的。

七月二十日，英明汗努尔哈赤率领众贝勒、大臣统兵向清河进发，当夭围困了鸦鹘关。

二十一日，镇守清河主将邹储贤得到后金军前来攻城的消息，即刻下令闭门拒守。

守城副手将领张旆要求出城迎战，邹储贤拒不听从。

守堡官张云程竭力相劝，邹储贤也不采纳，连出城打草的数百名军卒闻讯奔回城下，守城主将拒不开门收纳，一律拒之门外[27]。

邹储贤率领守军六千多人，利用城上设置的一千多座大炮以及滚木雷石等武器，据城设防，决心进行死守。

英明汗努尔哈赤统率大军，浩浩荡荡，于二十一日清晨到达清河城外。

他立即传令各旗战士，尽快围城。

八旗士卒有的冲到城下竖云梯，有的放箭，霎时将清河城围得水泄不通。

城上的守军凭险坚持抵抗，千炮轰鸣，滚木雷石齐下，石矢如雨。

八旗战士冒死冲击，当即死伤惨重，造成第一次猛攻失利。

英明汗努尔哈赤改变战术，命令全军退出城下，改近攻为远围。

后金军首战吃了败仗，努尔哈赤与众贝勒见城防严密，强攻不利，就决定进行招降。

派遣大额驸李永芳到城下劝降。

城守副将邹储贤见前来招降的是李永芳，即刻大怒，指骂李永芳是不义之人，并告诫说，若不即刻退去，将要放箭。

见李永芳招降不成，努尔哈赤与众贝勒只好再次强攻。

于是命令八旗战士环城猛攻。

守军顽强抵抗，炮声震天，火光闪闪。

八旗士卒死伤很多，攻战再次失利。

努尔哈赤被迫再次下令，全军后退，暂时停止攻城。

这样，八进八退，从清晨战到星斗满天，后金八旗士卒战死的多达数千。

最后，在夜幕掩护卞，努尔哈赤令各旗军士以板车挖城墙，致使清河东北城脚陷落，乘守军一时慌乱，后金军乘机叠尸登城。

邹储贤知道再守已经没有希望了，便焚毁衙门、屋宇、妻、孥等，亲自披甲上阵，遥见李永芳大骂赴敌，终于战死在疆场。

努尔哈赤挥军入城。

大英明汗努尔哈赤统兵在二十二日清晨攻破清河城时，城内尚有明官兵六千四百多人，户五百多家。

八旗兵入城后，与城内军民巷战，被杀军民以万计，剩下的部分壮丁，被强行驱赶北去。

为了防止明军再次占领清河城，努尔哈赤下令将城全部拆毁，又命令将三岔堡（今辽宁省铁岭县东南&ldo;三岔子&rdo;）到孤山堡（今辽宁省凤城县东北孤山屯）一带所有的房屋尽行焚毁，又下令拆毁了一堵墙（今辽宁省本溪县东北乌家城子）、碱场（今辽宁省复县西南谢屯公社盐场村）二城，使明军从清河城到抚顺城一带无存身之地。