1922年6月，在孙中山进行第一次北伐的时候，陈炯明在广州发动叛变，使粤军发生了大分化。

第一军随陈炯明叛变，后盘踞惠潮梅地区，主要有叶举、林虎、洪兆麟三部分。

叶举为总指挥，林虎为各路总指挥，洪兆麟为潮梅总指挥，计有林虎第一军，洪兆麟第二军，尹骥第三军，刘志陆第四军，熊略第五军，杨坤如第六军，李易标第七军，陈修爵独立师，号称五万众。

陈炯明则居住香港，遥为节制调遣。

陈炯明嫡系师长邓本殷，在陈炯明叛变后，亦占据南路八属，出任八属联军总指挥，申葆藩为副指挥，黄志恒为参谋长，苏廷有为右翼指挥官，号称二万众。

孙中山将北伐福建的粤军改为东路讨贼军，许崇智任总司令，蒋介石任参谋长，下辖三个军。

第一军军长黄大伟（后投陈炯明），辖王懋功、陈得平、丘鸿钧、龚师曾四旅；第二军军长许崇智（兼），辖许济、孙本戎、黄国华、张民达四旅；第三军军长李福林，辖林驹、吴近、袁德穉、郑泳深四旅。

其余粤军，由大元帅府直辖，称为中央直辖粤军即第四军，军长梁鸿楷，辖两师一独立旅和一支队。

第一师师长李济深，辖卓仁机第一旅、陈济棠第二旅；第三师师长魏邦平（后陈章甫、郑润琦）；独立旅旅长徐汉臣；支队司令丘耀西。

当时，由大元帅府直辖的还有以杨希闵为总司令的滇军，以刘震寰为总司令的桂军，以朱培德为总司令的赣军，以谭延闿为总司令的湘军，以樊钟秀为总司令的豫军。

此外，还有于右任的陕军，路孝忱的晋军，但懋辛、熊克武的川军，但都只有旗帜而无兵员。

粤军经此分化和改编以后，力量大为削弱，但孙中山为了巩固广州革命根据地，为了统一两广进而北伐，仍在作不懈的努力，多次亲率粤、滇、桂各军，进击东江陈炯明叛军及平定沈鸿英叛乱。

同时，孙中山又派中央直辖粤军李济深部入桂，扶助李宗仁、黄绍竑、白崇禧收拾广西局面。

1924年1月，在共产党的帮助下，孙中山改组了国民党，召开了国民党第一次全国代表大会。

接着，孙中山即进行军事上的整顿。

3月间，决定将原属中央直辖的粤军和东路讨贼军，统一改编为建国粤军。

以许崇智为建国粤军总司令，蒋介石为参谋长。

除李福林的第二军仍驻广州河南，未另编师外，其余各军部队，改编为四个师及若干独立旅。

计第一师师长李济深，第二师师长张民达，第三师师长郑润琦，第四师师长许济；另有徐汉臣、梁鸿林、卓仁机等独立旅及吴铁诚的警卫军。

建国粤军以孙中山的新三民主义、建国大纲、建国方略作为教育课程，孙中山期望把它建设成一支新型的革命军队。

1924年5月，孙中山建立的黄埔陆军军官学校正式开学。

黄埔军校的建立，得到粤军尤其是第一师在人力物力财力方面的积极支持。

师长李济深、团长邓演达分任教练部正副主任，邓演达还兼任学生总队长，后又出任教育长等。