袁世凯出山后，冯国璋便率军猛攻汉口，用重炮轰击人烟稠密的市区，革命军被迫退出汉口。

占领汉口后，冯国璋击退了黄兴所组织的反攻，不久又攻克了汉阳。

冯国璋因军功被朝廷授予二等男爵。

袁世凯在军事上占上风之后，便命令停止进攻，开始私下与革命军进行谈判，在清政府与革命军之间谋取私利。

此外，为了更有效地控制清政府，袁世凯这时即调冯国璋回京，接替载涛任禁卫军统领。

在辛亥革命中，冯国璋为袁世凯窃取革命成果，当上临时大总统立下了汗马功劳。

民国成立后，袁世凯实行独裁统治，谋刺宋教仁，解散国会。

孙中山发起二次革命，在江西、安徽、南京、上海等地首先起事。

冯国璋再次被袁世凯委以重任，出任江淮宣抚使兼第二军军长，督率第四、第五两师各一部及雷震春、倪嗣冲部，会同辫帅张勋沿津浦路南下，很快攻占徐州、蚌埠，再合攻南京。

攻下南京后，北洋军进行了残酷的洗劫。

冯国璋镇压二次革命立了大功，晋升陆军上将，出任直隶总督，江苏都督由张勋出任。

由于张勋不属袁世凯亲信，袁世凯不放心他占据江苏这块东南重地，于是，以张勋在南京纵兵烧杀抢掠引起外交压力为由，改张勋为长江巡阅使，冯国璋为江苏都督，这使得冯国璋不仅有了实力，也有了块富庶之区作为自己的地盘。

不久，袁世凯为抑制北洋将领私人势力的扩大，加强中央集权和个人对全国局面的控制，陆续抛出废省改道、裁撤都督、设立将军府等方案。

冯国璋作为地方实力派，正想扩展自己的地盘，当然联络其他北洋将领暗地抵制和反对，从而与袁世凯的关系出现了裂痕。

不过，袁世凯对冯国璋还是尽力笼络，当冯国璋原配夫人新故，袁世凯便撮合婚姻，把自己的家庭女教师周道如介绍给他做夫人，并派自己的第三妾金氏送亲到南京与冯国璋完婚。

其后，袁世凯积极推行帝制，但又不便自己出面，对冯国璋这样的手下大将也不说真话，使冯国璋极为恼怒，因此，拒绝参加&ldo;拥戴&rdo;活动。

但这样一来，袁、冯之间的裂痕更加扩大。

袁世凯称帝后，即下令调冯国璋入京做参谋总长。

冯国璋知道这是袁世凯的调虎离山计，装病而不拒不赴任。

1915年底，护国军兴，云南、广西等省宣布独立，冯国璋知道袁世凯气数将尽，暗中与各省北洋军人频繁联系，造成在袁世凯与护国军之外的第三种势力，将来准备出来收拾残局。

冯国璋暗中支持四川将军陈宦独立。

接着，冯国璋联络江西将军李纯、浙江将军朱瑞，山东将军靳云鹏，湖南将军汤芗铭，联名密电各省将军，共同压迫袁世凯取消帝制，惩办祸首。

这就是&ldo;五将军密电&rdo;。

直隶将军朱家宝得此密电，急忙告知袁世凯。

袁世凯惊得如五雷轰顶，几乎晕倒，绝望地说：&ldo;完了，一切都完了。

&rdo;1916年3月22日，袁世凯被迫取消帝制，但仍当大总统。